Puji Tuhan, Sekolah Kristen Kalam Kudus Jayapura pada tahun 2025 ini akan berusia 40 tahun. SKKK Jayapura didirikan oleh  Gereja Kristen Kalam Kudus Jayapura  untuk melayani Masyarakat dalam bidang Pendidikan. TK didirikan pada 15 Juli 1985, kemudian SD pada tahun 1988.selanjutnya SMP didirikan pada tahun 1994 dan SMA mulai melaksanakan kegiana belajar mengajar pada tahun 2001.

Berjalan dalam Anugerah Tuhan yang didasarkan kepada Visi : “Terbangunnya manusia utuh yang takut akan Tuhan, mandiri, dan berguna bagi dunia” menjadi dasar dan pedoman bagi Pengurus Yayasan, Pimpinan Sekolah, Guru dan Karyawa dalam melaksanakan tugas dan pelayanan kepada murid-murid SKKK Jayapura. Pembelajaran yang dilaksanakan berdasarkan nilai nilai dan karakter Kristiani  “Christian worldview” yang diimplementasikan dalam Motto : Dengan Kasih dan Disiplin meningkatkan prestasi.